一、制劑廠
按生物藥劑學和物理藥劑學原理，在化學原料藥中加入適當的制劑輔料，加工制成各種劑型的藥品。有的也生產植物化學藥或化學合成藥，自產自用。
二、生物化學制藥廠
中國的生物化學制藥廠絕大多數附屬于肉類聯合加工廠，作為一個綜合利用牲畜臟器生產藥品的車間,經濟合理地利用其新鮮臟器資源,提取出特定的有效成分，并制成合適的藥物制劑。除了一般的針劑、糖衣片、膠囊、糖漿等劑型外，對一些在水溶液中穩定性差的物質，常采用冷凍干燥設備制成凍干粉針劑。
三、抗生素廠
這種制藥廠非常重視菌種選育，采用發酵技術生產所需要的抗生素，然后采用而經濟的分離提純工藝制取成品,除提供商品原料藥外,也有自行分裝生產抗生素粉針劑以及水針劑、片劑、膠囊劑等。一般還配有淀粉和葡萄糖車間，以提供價格便宜、質量好的培養基原料。有些大廠配有所需溶劑和離子交換樹脂的生產車間。抗生素廠的發酵罐容量（m3）,一般為100～130,zui大的為300,并由電子計算機集中控制生產。中國一般為50～60,zui大的100。壓縮空氣的滅菌采用新工藝，發酵培養基的消毒趨向采用連續、、節能的設備。
四、化學合成藥廠
生產時一般采用搪玻璃反應罐，大型的容量（m3）3～5,中型的1～2，小型的0.1～0.5,常用的配套設備有：常壓或高真空蒸餾裝置、離心機、壓濾機。此外還有高壓反應釜、固定床或流化床、氣相反應裝置、液相催化反應裝置以及離子交換柱等。
五、中藥廠
中藥廠的生產是從中藥材開始，按照中醫理論和傳統工藝、加工炮制、生產可以直接服用的傳統中成藥，或現代劑型的針劑、片劑、沖劑、顆粒劑、栓劑、氣霧劑等。由于中藥廠的原料屬農副業產品，大多是一年一收，體積大，易發霉變質,其產品特別是蜜丸、膏劑,也易腐bai變質或生蟲、長螨。因此，中藥廠十分重視原料、產品貯存中的防霉、防蟲工作。近年來，由于采用了現代化的生產設備，如密閉粉碎機、提取設備、膜式蒸發器、噴霧干燥器以及程控包衣機等，大大改善了生產條件和工作效率，提高了產品質量和生產能力。
六、副產藥品的工廠
如糖廠利用其廢糖蜜發酵生產干酵母，或進一步加工生產核苷酸類藥品。
